جداسازی و بررسی توالی ژن هماگلوتینین ویروس انفلوانزای A/H1N1 عامل پاندمی 2009 (جدایه‌ی ایران)
Authors
Abstract:
زمینه: ویروس انفلوانزا پاتوژن تنفسی مهمی است که سالانه منجر به درصد بالایی از بیماری و مرگ ومیر می‌شود. ویروس جدید A/H1N1 (Novel) که در سال 2009 جمعیت زیادی از مردم جهان را درگیر کرد، از بازآرایی ژنوم سه نوع ویروس انفلوانزای انسانی، خوکی و پرندگان به‌وجود آمده است. با توجه به نقش مهم هماگلوتینین (HA) در عفونت‌زایی ویروس انفلوانزا، تعیین توالی ژنوم این پروتئین و بررسی تغییرات آن ضروری به‌نظر می‌رسد. در این مطالعه ژن HA ویروس A/H1N1 Novel جدایه‌ی ایران جداسازی و بررسی گردید. مواد و روش‌ها: در این مطالعه آزمایشگاهی، ژنوم ویروس از نمونه‌های مستقیم بیمار مبتلا به انفلوانزای Novel AH1N1 که با روش Real-timePCR و بر پایه پروتکل بین‌المللی در آزمایشگاه تحقیقات انفلوانزای انستیتو پاستور به تأیید رسیده بودند، استخراج شد و طول کامل ژنوم HA با استفاده از پرایمرهای اختصاصی به‌روش One step-RT-PCR تکثیر یافت. ژنوم تکثیر یافته بعد از کلونینگ در ناقل pGEM-T Easy، با آنالیز آنزیمی و تعیین توالی تأیید گردید. یافته‌ها: طول کامل ژن بیان کننده پروتئین HA به کمک PCR از نمونه‌های بیمار جدا شد و پس از الکتروفورز و مشاهده قطعه مورد انتظار 1777 جفت بازی، استخراج از ژل صورت گرفته و سپس در ناقل pGEM-T Easy کلون و تعیین ترادف شد. توالی حاصله با استفاده از نرم‌افزار chromas ویرایش 45/1 مورد بررسی قرار گرفت و نهایتاً با کد دستیابی "1/419001 HQ"در بانک ژنی ثبت گردید. نتیجه‌گیری: نتایج آنالیز نوکلئوتیدی نشان داد که توالی فوق با تمام سکانس‌های گزارش شده از سراسر دنیا از جمله سویه توصیه شده برای واکسن مطابقت دارد.
similar resources
تولید آنتی‌بادی پلی‌کلونال علیه ناحیه حفاظت‌شده هماگلوتینین ویروس آنفلوآنزا (A/H1N1/2009) سویه تهران: گزارش کوتاه
Background: The influenza virus is one of the most important factors for higher morbidity and mortality in the world. Recently, researchers have been focused on influenza conserved antigenic proteins such as hemagglutinin stalk domain (HA2) for vaccine production and serological studies. The HA2 plays a major role in the fusion of the virus with host cells membrane. The immunity system enables ...
full textبررسی توالی ژن پروتئین پوششی جدایه‌های ایرانی ویروس ایکس هوستا
در بهار سال 1390 طی بازدیدی از مراکز تولید گیاهان زینتی در شهرستان‌های کرج و تنکابن، تعدادی بوته هوستا (Hosta sieboldiana.) با علائم موزائیک، پیسک و بدشکلی برگ‌ها مشاهده شد. تعداد 17 بوته علائم‌دار انتخاب شد و احتمال آلودگی آنها به ویروس‌های موزائیک آرابیس (Arabis mosaic virus-ArMV)، موزائیک خیار (Cucumber mosaic virus-CMV)، پژمردگی لکه‌ای گوجه‌فرنگی (Tomato spotted wilt virus-TSWV)، لکه نکروز ...
full textمطالعه فیلوژنتیکی ویروس انفلوآنزا A، ساب تایپ H5N1 ، در همسایگان ایران طی سال های 2006-2003
زمینه و اهداف: ساب تایپ H5N1 ویروس انفلوآنزا، که با قدرت کشندگی بالا می باشد، در سالهای اخیر باعث تلفات زیادی در منطقه آسیا و به‌ویژه در کشورهای آسیای شرقی و خاور میانه شده‌است. هدف این مطالعه تعیین فیلوژنتیک ویروس انفلوآنزا A، ساب تایپ H5N1 ، در همسایگان ایران طی سالهای 2006-2003 بود. روش بررسی: از الگوریتم‌های بیوانفورماتیکی همترازی سکانس‌ها استفاده شد. سکانس‌های ژنی و پروتئینی ژن هماگلو...
full textکلونینگ ژن پروتئین F ویروس نیوکاسل و تعیین توالی آن
ویروس عامل بیماری نیوکاسل (NDV) یکی از مهمترین عوامل بیماری های ویروسی طیور می باشد ، که سبب واگیری و مرگ ومیر شدید در طیور و گونه های متعددی از پرندگان می شود.پروتئین F ویروس جهت نفوذ و تکثیر ویروسی در حیوانات آلوده نقش محوری دارد. کلونینگ و بیان ژنوم کد کننده پروتئین F جهت تولید واکسن تحت واحد و همجچنین تولید آنتی بادی مونوکلنال علیه پروتئین F می تواند گتمهای جدیدیبرای شناسایی و پیشگیری از بی...
full textمقایسه توالی اسیدهای آمینه در محل شکسته شدن پروتئین هماگلوتینین سه ویروس آنفلوانزای طیور (H9N2)
full text
تعیین توالی و آنالیز فیلوژنتیک ژن نورآمینیداز ویروس آنفلوانزای تحت تیپ 2N9H پرندگان در ایران
بیماری آنفلوانزا یکی از مهمترین بیماری‌های ویروسی طیور صنعتی است. در این مطالعه، توالی ژن نورآمینیداز دو سویه ویروس آنفلوانزای طیور شامل 1998/101A/Chicken/Iran/ZMT- و 2006/1A/Chicken/Iran/NGV-مورد بررسی قرار گرفت. ویروس اولی در سال 1377 از موارد اولیه همه‌گیری آنفلوانزا و ویروس دومی از همه‌گیری آنفلوانزای طیور در گله‌های گوشتی با تلفات بالا در سال 1385 جدا شده است. آمینواسید‌های محل جذب خ...
full textMy Resources
Journal title
volume 17 issue 2
pages 182- 190
publication date 2014-05
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
No Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023